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Plant Transcriptional Regulatory Map
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我们致力于为广大科研人员提供一个关于植物转录因子和转录调控、集数据和分析于一体的高质量平台，为研究和理解植物转录调控系统保驾护航。
通知：这是PlantRegMap的镜像。
预测和分析工具
- BLAST - 将蛋白或核酸序列比对至植物转录因子。
- TF prediction - 基于蛋白或核酸序列鉴定转录因子。
- ID mapping - 通过BLAST将输入ID转换为PlantRegMap内部ID。
- Binding site prediction - 基于输入序列预测转录因子结合位点。
- FunTFBS - 一个筛选功能性转录因子结合位点的算法。
- Regulation prediction - 预测转录调控关系并鉴定富集的上游调控者。
- GO enrichment - 基于包含165个植物物种的系统性GO注释寻找富集的GO条目。
- TF enrichment - 针对输入基因集合寻找富集的转录因子。
How to Cite:
- Tian F, Yang DC, Meng YQ, Jin JP and Gao G. (2019). PlantRegMap: charting functional regulatory maps in plants. Nucleic Acids Research, gkz1020.
- Jin JP, Tian F, Yang DC, Meng YQ, Kong L, Luo JC and Gao G. (2017). PlantTFDB 4.0: toward a central hub for transcription factors and regulatory interactions in plants. Nucleic Acids Research, 45(D1):D1040-D1045.
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Jin JP, He K, Tang X, Li Z, Lv L, Zhao Y, Luo JC, Gao G. (2015). An Arabidopsis transcriptional regulatory map reveals distinct functional and evolutionary features of novel transcription factors. Molecular Biology and Evolution, 32(7):1767-1773.
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for Bioinformatics, Peking University Last Modified: 2019-10-11 Questions or Comments, please contact  |
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